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ACD /结构阐释者套件

ACD/结构说明套件:它是如何工作的
ACD/结构说明套件:它是如何工作的

您是否对结构化数据进行了所有可能的处理?

使用ACD/结构解析器套件,科学家们能够执行快速的复制、高级验证、使用NMR和其他技术快速表征结构,并对复杂的未知结构进行重新解析。

随着越来越多的光谱库(包括PubChem数据库)的使用,Structure Elucidator套件允许研究人员使用实验光谱快速发现和验证化学结构,这已经被预先识别(dereplication)。

如果一个结构在数据库中没有被识别出来,科学家可以使用这个软件应用先进的算法,定量地评估一个拟议的结构和实验光谱之间的匹配度——甚至确定可能是更好匹配的可行选择。该软件包括广泛的结构表征和验证工具,很容易访问。

对于真正复杂的问题,结构解析器套件允许新创结构说明,产生一套完整的符合实验数据中观察到的相关关系的所有结构。它还支持使用其他分析信息来缩小结构的可能性——所有这些都有助于更快、更有效地解决结构问题。

一个使用ACD/结构解析器套件的示例工作流

ACD/结构说明套件幻灯片
点击查看幻灯片

功能

ACD/结构解析器套件包括所有的高级处理和解释功能和算法ACD /核磁共振工作簿套件ACD /女士工作簿套件。结构解析器套件的关键特性是:

供应商 数据格式 所需的参数文件 可选参数文件
ACD /实验室 * .spectrus,*。gnr、* .esp *。三、* .smp
橡子核磁共振有限公司 * .fid,* .nmr,* .2d
安捷伦(瓦里安) 数据,*。fid0001 fdf。fdf, *。txt, fid,相位文件,数据* (VNMR, VnmrJ, SpinSight) acq、proc procpar acq_2、文本
美国信息交换标准代码一个 * . txt;*。对,*。csv, * .asc
力量 *。爵士,*。rr, *。fid, *。1r, *.1i,
*。2rr, *。*(DISNMR, UXNMR, XWINNMR, WinNMR, TopSpin)
acqus, procs, acqu2, proc2s, *。fq, *。fa1, *。fa2, *。fp1, * .fp2 标题、intrng *。问,* .ti2
费利克斯 * . *
银河 * .spc
高斯输出 *。日志,* .out
通用电气 * .raw,* . *(Nicolet)
* . *(Omega)
JCAMP * .dx;* .jdx
JEOL有限公司 *。一个ls, *.jdf, *.nmfid, *.nmf, *.bin, *.nmdata, *.nmd, *.gxd, *.* (Alpha, Generic, Delta, Lambda) *。gxp, * .hdr exp.param, exp.par
Lybrics * . *
Magritek * .1d;* .2d
MSI费利克斯 * . *
Nanalysis * .dx
Nicolet * .dat
坚果 * . *
牛津仪器 * .fid
QOneTec * .nmr
Tecmag *。tnt, *。*(MacNMR)
热科学一个 * .spc
picoSpin (* .jdx)

一个也支持文件导出

供应商 数据格式 扩展 评论
ACD /实验室 ACD / Spectrus
ACD / SpecManager
* .spectrus,* .esp
安捷伦科技公司 1100系列LC/MSD四轴和离子陷阱系统 * 00,* .yep DAD数据和单波长色谱。分束器可用
ChemStation * 00 分束器可用
LC TOF * .wiff
MassHunter(6000系列) *。斌 整个*。D文件夹应使用。安捷伦组件需要Microsoft . net版本2。DAD可以导入和MS/MS分离控制。
OpenLab Rev. C.01.07, C.01.08, C.01.09 * .D UV, LC-UV和LC-MS
整个*。D文件夹应使用
* 00,*。ch, * .uv
应用生物系统公司 水手数据Explorer ASCII LC/MS * . txt 但是有的数据只
力量和安捷伦 Agilent或Bruker LC/MS离子阱 * .yep LC-MS和DAD数据
力量 指南针(准确的海量数据) * .d 整个*。D文件夹应使用。Bruker组件需要Microsoft . net 3.5版本。MaXis影响数据可能存在的问题。
日立 LIT-TOF * .dat 不再支持导入
m - 8000和d - 7000 * .msd;* .dad LC-MS和DAD数据
JEOL(日本) JEOL-DX *。jsp、* .jpf * .jmc 单质谱和色谱曲线
JEOL K9 * .spe LC (GC - ms)的数据
JEOL XMS * .dat 气相色谱数据
LECO公司 色谱- hrt™for Citius™(LC)和Pegasus®(GC) HRTs * .smp GC/MS或LC/MS数据;具有内源CID的LC/MS提供单独的前体和片段离子通道;支持LECO GC-TOF MS数据。
Matlab /特征向量的研究 DSO格式一个 * .mat 单质谱和LC(GC)-MS数据
国家标准与技术研究所 NIST女士软件 * .msp 使用Lib2NIST将.msp转换为支持的格式(。hpj或.sdf)
NIST自卫队图书馆 * .sdf 分束器可用
开源 美国信息交换标准代码一个 * . txt 单身女士只
JCAMP一个 * .dx,* .jdx 分束器可用
mzML
netCDF一个 *。它强调,* .nc 单质谱和GC -MS数据
PerkinElmer TOFData * .tofdata *
TOFData重心 * .tofline
SCIEX PE SCIEX API到Piff *。~π,皮夫*。~
SCIEX 分析师 * .wiff,* .wiff.scan 单质谱、LC-MS和大部分LC-MSn进口。分束器可用。当前未导入的UV数据。
光光谱支持通过出口到NetCDF。
分析师QS * .wiff 单质谱、LC-MS和大部分LC-MSn进口。分束器可用。
分析师特遣部队 * .wiff
日本岛津公司公司 GCMSsolution * .qgd 气相色谱数据
LabSolutions * .lcd,* .qgd ioModule支持QTOF数据和TIC或SIM跟踪
LCMS-IT-TOF * .lcd 质,质n数据只。需要在同一台计算机上安装供应商软件。
LCMSsolution * .qld DAD数据和单波长色谱。可能需要在同一台计算机上的供应商软件。
热科学 银河 * .spc Export仅适用于单个MS
Xcalibur * .raw 已配置扫描过滤器参数进行数据拆分
Unidata netCDF *。它强调,* .nc 分束器可用
瓦里安 1200 * .dat 分束器可用
土星2000 * .sms 分束器可用
XMS *。xms, * .sms 分束器可用
水公司 授权2和3
(2D及3D PDA数据)
通过连接到1或者在ACD/授权附加组件的帮助下
授权2和3 (3D MS数据) 但是有的数据。通过连接到1或者在ACD/授权附加组件的帮助下
MassLynx * .raw 包含_functns的文件夹中的所有文件。inf文件是导入数据所必需的文件。分束器可用。
Micromass OpenLynx * .rpt 分束器可用
32(2D及3D PDA数据) 不再支持导入
UNIFI 通过连接到1

一个也支持文件导出
1连接到实用程序需要在同一台计算机上的供应商软件。它在Citrix中不起作用。

供应商 数据格式 扩展 评论
ACD /实验室 ACD / Spectrus
ACD / SpecManager
* .spectrus,* .esp
安捷伦科技公司 ChemStation一个 * .uv
惠普84552 * . wav
安捷伦(瓦里安) 卡里紫外线 *。b *;* .d *
ASCII单列,双列和多列 * . txt;* .prn;* . csv;* .asc
力量 作品 * . *
DeltaNu公司 * .spc
Dionex Chromeleon一个 通过连接到1或者使用ACD/Labs Chromeleon插件
自由/开源软件NIRSystems * .da
JASCO公司 j - 700 * .jws
JCAMP, JCAMP multispectra * .dx;* .jdx
LabControl * .uvd;* .irs
MATLAB DSO一个 * .mat
海洋光学 * . *
PerkinElmer仪器 * .spgydF4y2Ba
日本岛津公司公司 红外 * .irs
热科学 银河 * .spc
马特森 * . *
Nicolet OMNIC * .spa;* .spg
水公司 授权2和3 通过连接到1或者使用ACD/Empower附加组件
MassLynx * inf

一个二极管阵列检测器(DAD)支持连字符数据。
1连接到实用程序需要在同一台计算机上的供应商软件。它在Citrix中不起作用。

供应商 数据格式 扩展 评论
ACD /实验室 ACD / Spectrus
ACD / SpecManager
* .spectrus
* .esp
矩阵一个 * . txt
安捷伦科技公司 1100系列LC/MSD四轴和离子陷阱系统 * 00,* .yep UV, LC-UV和LC-MS
ChemStation
启B.02.01、B.03.01 B.04.01、B.04.02 B.04.03 C.01.04
* .D UV, LC-UV和LC-MS
整个*。D文件夹应使用
* 00,*。ch, * .uv
EZChrom * .dat 紫外线的痕迹。需要在同一台计算机上安装供应商软件。
开放实验室C .1.04 * .D UV, LC-UV和LC-MS
整个*。D文件夹应使用
* 00,*。ch, * .uv
开放实验室Rev. C.01.07, C.01.08, C.01.09 * .D UV, LC-UV和LC-MS
整个*。D文件夹应使用
* 00,*。ch, * .uv
力量和安捷伦 Agilent或Bruker LC/MS离子阱 * .yep LC-UV和质
力量 指南针
(准确的质量数据)
* .D 质LC-UV,紫外线
整个*。D文件夹应使用
MATLAB DSO一个 * .mat
开源 美国信息交换标准代码一个 * . txt;* .prn;* . csv;* .asc
PerkinElmer TotalChrom™ * .raw 导入支持通过连接到2直到ACD/Labs products v. 2018
图片的解决方案 * .dat.csv LC痕迹
SCIEX 分析师 * .wiff LC-UV和质
日本岛津公司公司 LCMS-IT-TOF * .lcd 质和LC-UV1
需要在同一台计算机上安装供应商软件
LCMSsolution * .qld LC-MS, LC-UV和UV痕迹
在同一台计算机上可能需要供应商的软件
热科学 阿特拉斯 PDA和爸爸的追踪通过连接到2,或使用ACD/Atlas附加组件
Chromeleon 6;7 UV和LC-UV,通过连接到2,或使用ACD/Chromeleon附加组件
通用分析标记语言层次结构 * .gaml LC-UV和LC-MS数据
Xcalibur * .raw LC-MS, LC-UV和UV痕迹
Unidata netCDF *。它强调,* .nc LC-MS, LC-UV和UV痕迹
水公司 授权LCUV数据 * .arw LC-UV
授权2和3 UV, LC-UV和LC-MS痕迹,通过连接到2或者使用ACD/Empower附加组件
MassLynx * .raw LC-UV和质
Micromass OpenLynx * .rpt LC-UV和质
UNIFI 通过连接到2

一个也支持文件导出。
1进口*。来自5.42SP2版本的lcd文件,供应商软件应该安装在同一台计算机上。
2连接到实用程序需要在同一台计算机上的供应商软件。它在Citrix中不起作用。

好处

包括PubChem数据库

在与PubChem的合作中,ACD/Labs很高兴地发布了aPubChem数据库自由使用ACD/结构说明套件。该数据库包括ACD/Labs预测的NMR化学位移、结构和PubChem ID号。

资源

本系列网络研讨会分为两部分,第二部分将继续讲解未知结构的使用案例。我们演示如何使用分子式,案例可以找到最适合数据的化学结构。
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新的结构说明教程

为了配合新书《基于光谱数据的计算机结构解析》,我们已经发布了一个免费下载教程软件包*基于ACD/结构说明器套件。该软件包括实验光谱,允许用户探索各种案例技术,熟悉结构说明界面,并与独特的分子连接图交互。

*该软件是免费的,仅供教育使用,并且不导入新的分析数据/光谱或保存结果到数据库。