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用ACD/LogD计算分布系数

根据化学结构计算辛醇-水的分布系数(logD)
计算辛醇-水的分布系数(对数)D)从化学结构

从化学结构预测辛醇-水的分布系数

绘制一个化学结构或复制/粘贴从您最喜欢的绘图包最准确的分布系数值,跨越所有化合物物种,在各种ph。

查看日志D结果作为一个列表在离散的pH值,或导航一个图的日志DpH值。

日志是如何D值计算?

分配系数是所有形式的化合物(包括中性和电离)在两相(辛醇和水缓冲液)中的浓度之和的比率。每种形式在缓冲液和正辛醇之间都有自己的分配趋势。其特征是pH值无关分配系数-对数P物种(例如,日志P0、日志P-、日志P2+等)。

日志D预测算法是在对数分段算法的基础上计算这种分割常数的P对于中性形式和一系列校正因子,考虑诸如分子中电离的类型和位置等方面。日志D,分布系数作为所有分子物种分布的函数计算,由pH控制,并由pK预测一个

感知器提供了各种预测对数的算法P和pK一个值和这些值的任何组合都可以被选择(并设置为默认值)来预测分布系数(日志)D).

日志D计算器的功能

  • 预测日志D从结构、SMILES字符串或化学名称
  • 查看日志D生理相关ph值(胃1.7,十二指肠4.6,肠回肠6.5,血液7.4,结肠8.0)
  • 单击并拖动绘图(日志)Dvs pH)为日志DpH值
  • 从各种日志中进行选择P和pK一个算法的日志D计算(软件默认:日志PConsenses和pK一个经典)
  • 通过对实验数据的训练,扩大模型的适用性,提高对新化学空间的精度
  • 根据化学结构、SMILES字符串或名称计算logD
    计算日志D来自化学结构、SMILES字符串或名称
  • 查看生理相关pH值的logD值,或方便地定义感兴趣的pH值
    查看日志D值在生理相关的pH值,或方便地定义感兴趣的pH值
  • 查看logD在pH值0到14之间的任何pH值
    查看日志DpH值在0到14之间D对pH值

机器学习日志D计算器

因为日志D计算依赖于日志P和pK一个预测算法,日志D可培训性可以通过对单个日志的培训来实现P和pK一个模型。这有助于提高预测精度,扩大模型对新的化学空间的适用性。

部署选项

桌面/瘦客户机

带有图形用户界面的个人计算机的软件安装。完整的物理化学,ADME和毒性计算器模块可用(具有培训能力),包括PhysChem Profiler bundle。

批处理

筛选数以万计的化合物与最小的用户干预-兼容微软Windows和Linux操作系统(OS)。插件到企业内部网或工作流工具,如管道试点。

Percepta门户/瘦客户机

基于web的应用,用于预测分子性质(物理、ADME和毒性)和数据分析。可提供KNIME集成组件。

主机在您的企业内部网或云。适用于Linux、Windows操作系统。

资源

看看ACD/Log有多好D在预测日志中执行的模块D用于1659种药物化合物。并给出了用实验数据训练算法前后的结果。
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本应用笔记讨论了使用预测模型的机器学习(模型训练)能力来提高准确性的重要性。
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分配系数是多少?

分布常数(D),也被称为表观分配系数,是一个可电离分子的亲水性(“喜水”)或疏水性(“怕水”)的量度。它代表了一种化合物在两种不混溶相(通常是辛醇和水缓冲液)中差异溶解的趋势,同时考虑了基于ph值的电离物种的分布。它也被称为分配系数。例如,见甲胺在辛醇-水中的分配,以及分配常数如何描述分配:


日志D预测模型将分布常数估计为对数比率(logD或堵塞D).分布系数作为可电离化合物的亲脂性(或疏水性)的定量描述符。

日志是如何D值使用?

药物Discovery-LogD数值用于理解和预测活性化合物在生理条件下的体内行为。由于整个胃肠道的pH值环境非常不同(从胃的1.4到结肠的8),了解一种药物铅在生理条件下的亲脂/亲水性有助于科学家了解在本质上不同的化学环境下的行为。

日志D值在色谱方法开发中也很重要(用于选择适当的pH值和色谱柱;在农业化学方面开发除草剂和杀虫剂;在环境化学中了解污染物的行为,以及在许多其他消费产品的开发中。